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南台寺在掷钵峰下的三生塔南面，号称“天下法源”，距福严寺2公里不到。南朝梁天监年间海印禅师创建此寺，唐天宝年间禅宗七祖弟子希迁和尚将它定名为南台寺。南台寺风景宜人，古寺四周绿树环抱，寺内有虎耳草、七里香等奇特植物，最稀奇的是一种叫雪花的高山植物，它枝干低矮，开着金黄色的花，却不长叶子。
南台寺被日本佛教曹洞宗视为祖庭，曹洞宗和南台寺所属的临济宗同出禅宗南宗创始人慧能一宗。清光绪二十九年（1903年），日本曹洞宗高僧梅晓来南台寺接连宗源，赠了不少藏经给南台寺，留下了“梅晓赠经”的佳话。
南台寺自唐代创建后，曾经废圮,直到宋代乾道元年(公元一一六五年) 才得重新修缮。明朝初年,寺院荒废。明弘治年间,元碍和尚重建。清初,寺院又废圮。有些僧徒乘机分移寺产,在山下岳庙旁各建小寺,自称南台嫡系正派。 光绪年间衡阳人淡云和尚与其徒 ,见新老南台真伪并出,“争利于禅林,有辱佛门”，便下决心重振南台正宗。光绪十六年(公元一八九０年)，他找到了南台寺旧址。募捐一万八千余贯，光绪二十八年(公元一九０二年)开始动工，历时四年，到乙已年(公元一九０五年)将寺建成。寺宇规模宏大，超过历代所建的规模。南台寺有四部分， 山门挂“古南台寺”匾额。二进为弥陀殿。里面有欢喜佛像，坦腹露胸，满脸笑容，谁看了都会欢喜他。正门前有“南台禅寺”门额，三进为佛殿，有塑像饰龛，四进为法堂、祖堂、云水堂。两厢各有斋堂、禅堂、客房等。寺中大小舍房一百余间。
光绪癸卯年间(公元一九０三年)，日本曹洞宗法脉高僧梅晓和尚(六休上人)，自称是石头和尚第四十二代法孙。专程来南台寺。这时南台寺的重建工程正在进行，梅晓见屋基楚楚、砖墙厚实，规模宏大，十分高兴。当即向淡云和尚提出：寺宇落成，愿赠“藏经”一部。淡云和尚表示乐意接受。他回国后第四年(公元一九○七年)，就率瓴日本佛徒数十人，亲自护送到南台寺，并举行了隆重的赠经仪式。这是当时一件盛事。它成了中日友好往来源远流长的历史见证。自梅晓赠经以后，至今日本佛教徒不时派出代表团来南台寺礼祖。南台寺为中日友好交往树立了友谊的丰碑。
南台寺四周绿荫蔽日，古木森茂，寺前有一片落叶杉林，名叫水杉林。树高达二十余米，直插云天，羽状针叶，树影婆娑。
南台寺有一条小路通南岳古镇。中经一个大石坡，石坡间有石磴数百余级。在岩石上，好象天梯架于岩壁上，故名天生磴。梯下悬崖峭壁，有挂着铁链的石栏杆，山坡旁边有一石，名叫金牛石，相传上面印有金牛足迹。明正德十年(公元一五一五年)秋天，夏良用在金牛壁刻上了一首诗云：“手招黄鹤来，脚踏金牛背。尘世无人知，白云久相待。”沿山坡下行四里即到黄庭观，从此走上坦道，便可迤逦直达南岳古镇。如今南台寺已修
